Kingdom Hearts II je pokračováním Kingdom Hearts a Kingdom Hearts: Chain of Memories a stejně jako předchozí dvě hry se zaměřuje na pokračující boj Sory a jeho přátel proti Temnotě. Nabízí také řadu vylepšení oproti originálu s mnoha novými funkcemi, především Sorovu funkci Drive Form, vylepšený fotoaparát a možnosti v boji nazvané „Reaction Commands“.
Tématem hry je „Sanctuary“ (japonská verze: „Passion“) v podání Hikaru Utady.
Je to třetí hra v sérii, ale pátá hra v chronologické časové ose po Kingdom Hearts: Birth by Sleep, Kingdom Hearts, Kingdom Hearts: Chain of Memories a Kingdom Hearts 358/2 Days.
Království Srdcí II začíná tam, kde Království Srdcí: Řetězec vzpomínek a Království Srdcí 358/2 Dny příběhu skončily. Sora a jeho společníci spali asi rok a po tom, co se stalo na hradě Oblivion s Organizací a Naminé, se jim vrátily vzpomínky. Když se Sora probudí, nakonec dorazí do Města soumraku, místa, kde žil záhadný chlapec Roxas, než náhle odešel. Sora získal nové šaty a síly a vydal se na cestu znovu, aniž by si uvědomoval události, které se odehrály v „Řetězci vzpomínek“. Sora pokračuje ve svém pátrání tím, že odemyká cesty do nových světů, učí se o „Nikolech“ a bojuje proti „Bezsrdcím“, stejně jako čelí zbývajícím členům záhadné Organizace XIII. Jak hra pokračuje, Sora se dozvídá o Roxasu a o tom, kolik toho mají společného.
Příběh začíná tím, že hráč ovládá Roxas v „Městě soumraku“. Roxas sní o Sorových dobrodružstvích, zatímco se v Městě soumraku během Roxasových letních prázdnin začínají odehrávat stále záhadnější aktivity, zejména v posledním týdnu. Poté, co Roxas získá Keyblade, aby se ubránil před Nobodies, přijde čtvrtý den jeho posledních prázdnin do kontaktu s mladým mužem v černém jménem Axel. Axel vypadá, že Roxase zná, ačkoliv Roxas si na něj nevzpomíná. Roxas se nakonec dostane do opuštěného sídla, kde mu dívka jménem Naminé oznámí, že je Nikdo, ačkoliv v té době ještě nevěděl, co je to Nikdo. Nakonec, konfrontován záhadným mužem v červeném plášti jménem DiZ, Roxas objeví Soru, Donalda a Goofyho, jak spí ve skrytém sklepě sídla. Zdá se, že Roxas se Sorou splyne z vlastní vůle a vzdává se své vlastní existence, aby ho probudil. Když se Sora, Kačer Donald a Goofy probouzejí ze svého rok trvajícího spánku. Jiminy Cricket, který předtím zaznamenával dobrodružství trojice, zjistí, že jeho deník je nyní zcela prázdný, až na poznámku: „Thank Naminé“ (kterou napsal sám Jiminy během Řetězu vzpomínek).
Po setkání s Petem, novým padouchem, a rozhovoru s Yen Sidem, je strana informována, že musí znovu navštívit mnoho světů, aby je ochránila před Bezsrdečnými i před Nikoly ve snaze zastavit Organizaci XIII. Patří mezi ně jak stará, ale značně změněná místa, jako je Dutá bašta, tak i zbrusu nové světy, se kterými se strana nikdy předtím nesetkala. Během svých cest Bezsrdeční, v čele s oživenou Zlobou a Organizací, znovu získají moc a nakonec donutí Soru čelit masivní armádě Bezsrdečných, kteří útočí na Dutou baštu. Cestou se dozvídají, že Ansem, se kterým bojovali před rokem, byl ve skutečnosti Bezsrdečný Xehanort a že Nikdo Xehanortu, Xemnas, je vůdcem Organizace XIII. Dozvědí se také, že Xehanort byl učedníkem skutečného Ansema, který je nezvěstný.
Po bitvě se objeví Xemnas a odhalí svůj konečný cíl: Nobodies plánují vytvořit další Srdce Království, bránu do srdce všech světů, která Nobodies pravděpodobně umožní získat zpět svá srdce a znovu plně a kompletně existovat jako celí lidé. Po konfrontaci a porážce dalších členů Organizace, kteří působili potíže ve světech, které v průběhu hry navštívil, se Sora vydá na Svět, který nikdy nebyl, aby si s Organizací nadobro vyrovnal skóre; také se nakonec shledá se svými přáteli Riku a Kairi. Sora se dozví pravdu i o Roxasu; on a Naminé jsou, respektive, Sorovi a Kairini Nobodies, vytvořeni, když ztratili svá srdce v původní hře Srdce Království, když se Sora obětoval, aby vrátil Kairino srdce do jejího těla a zničil Ansemův temný meč.
Kingdom Hearts II nabízí řadu klíčových rozdílů oproti původním Kingdom Hearts. Zatímco základní hratelnost zůstává stejná, pro vylepšení zážitku byly přidány nové funkce. Dvěma nejpozoruhodnějšími jsou Sorův systém Drive, který mu umožňuje splynout s jedním nebo oběma stranickými spojenci a převzít nové schopnosti, a Reakční příkazy, které umožňují Sorovi a/nebo členům jeho party provádět v průběhu bitvy speciální manévry. Kromě toho existují nové a vylepšené schopnosti, stejně jako speciální schopnosti, jako je Glide, které lze získat pouze vyrovnáním Sorových Drive formulářů. Další věcí, které je třeba si všimnout, je, že k poražení šéfa musí být provedeno kombo.
Výrazně změněn je také systém Gummi Ship; místo vesmírné střílečky nyní lodě fungují spíše jako železniční střílečka, která cestuje po pevné cestě a zároveň umožňuje hráči starat se pouze o zničení různých nepřátel roztroušených po dráze. Lodě mohou být nyní vybaveny vlastními schopnostmi, přibyly nové typy Gummi, jako je Slash Gummi, a vysoce postavené Gummi Ships mohou mít dvě doprovodné lodě, zvané Teeny Ships, které jim mohou pomáhat v boji.
;Dutá bašta/Radiant Garden
;Olympus Coliseum/Underworld
;Halloween Town/Christmas Town
;Svět, který nikdy nebyl
Kingdom Hearts II Final Mix
Kingdom Hearts II Final Mix je balíček obsahující Kingdom Hearts II Final Mix, vylepšený remake Kingdom Hearts II obsahující více nepřátel, dodatečné scény a mnoho dalších prvků, jako jsou rozšířené světy a Kingdom Hearts Re:Chain of Memories, který dává hráči přístup k více kartám, pokud je na paměťové kartě soubor pro uložení Kingdom Hearts II Final Mix.
Kingdom Hearts II Final Mix byl znovu vydán ve vysokém rozlišení jako součást Kingdom Hearts HD II.5 ReMIX.
Hra Prvky: Hra v Kingdom Hearts • Magic
Disney Worlds: Wonderland • Deep Jungle • Olympus Coliseum/Underworld/Olympus • Agrabah • Atlantica • Halloween Town/Christmas Town • Neverland • Hundred Acre Wood • The Land of Dragons • Beast’s Castle • Port Royal/The Caribbean • Pride Lands • Space Paranoids • Dwarf Woodlands • Castle of Dreams • Deep Space • La Cité des Cloches • The Grid • Prankster’s Paradise • Country of the Musketeers • Toy Box • Kingdom of Corona • Monstropolis • Arendelle • San Fransokyo • Game Central Station/Niceland/Cy-Bug Sector/Candy Kingdom