Houghton šel ve stopách svého bratra Shanea a začal pracovat v animaci. Pracoval v Nickelodeonu jako storyboardový umělec na přehlídkách, jako Fanboy & Chum Chum a Harvey Beaks, na druhé z nich spolupracoval se svým bratrem.
Dostal se k práci v Disney v obrovských seriálech, jako jsou Wander Over Yonder a Gravity Falls a pomáhal v epizodě „Ucpaný“ Mickey Mouse. Chris a Shane se nakonec dočkali velkého průlomu při tvorbě seriálu Big City Greens, který se v té době jmenoval Country Club. Chris sám namluvil hlavní postavu Cricket Greena, který byl fyzicky založen na staré fotce z dětství, kde byl sám. Namluvil také Falcon Tuxedo v epizodě „People Watching“ a Tophera v epizodě „Animation Abomination“, postavu, která má sloužit jako sebeparodie. Namluvil Billa v epizodě The Owl House „Edge of the World“.