Epsilon (イプシロン, Ipushiron) je „Neznámý manipulátor s energií: Testovací model“ a hlavní antagonista hry Mega Man X: Command Mission. Slouží jako vůdce Povstalecké armády a až do poslední kapitoly působí jako hlavní antagonista hry díky chytré manipulaci plukovníka Redipse.
Epsilon zorganizoval vzpouru na ostrově Gigantis a je vůdcem Rebelie. Hrdý a uvolněný je obvykle velmi stoický a tichý, jeho přítomnost je v tomto duchu zdůrazněna jeho nevídanými (na Reploida) africkými rysy. Epsilon byl jediným Reploidem, který přežil experimenty s infuzí kovu Supra-Force, což mu dávalo zvýšenou inteligenci a silové schopnosti. Všichni ostatní dobrovolníci v experimentu buď zešíleli a stali se Maverickem, nebo rovnou zahynuli. I když si Epsilon zachoval zdravý rozum, uvědomil si, že se může pokusit zopakovat stejné výsledky, jaké měl na jiných Reploidech, a tak zinscenoval vzpouru za Reploid Freedom, protože věřil, že Reploidi se mohou vyvinout za to, co z nich lidé udělali, a stát se pokročilejšími.
Povstání vedl s velkým charismatem a vůdcovstvím, a to natolik, že Zjizvený ksicht a Ferham byli ochotni za něj nasadit své životy. Dokonce projevil inteligenci, aby si oba dva ponechal jako hlavní ruce, protože i Botos se zdál mít v porovnání s ním o něco menší důvěru. Jeho tělo také stále obsahuje značný kus kovu Supra Force z experimentů, ukrytý pod černým roztrhaným pláštěm, který připomíná Sigmu X6 (tyče na jeho ramenou také připomínají Profesora Sigmu X7). Epsilonovo jméno a motiv mají podobnost se Sigmou obecně, protože oba jsou velcí, zruční, vizionářští Reploidi pojmenovaní podle písmene řecké abecedy.
Po skončení hry byl Epsilon posmrtně zproštěn všech Maverickových obvinění, nejspíše kvůli zdrženlivosti, kterou projevil tím, že během své činnosti nezabil žádné nevinné (vyhnal lidi z Giga City bez újmy, prostě jim zakázal se vrátit) a kvůli tomu, že celý jeho status Mavericka vznikl v důsledku Redipsovy manipulace s událostmi.
Epsilonovy mimořádné schopnosti jsou výsledkem toho, že přežil testy Supra-Force, jeho síla je tak velká, že k jeho porážce bylo zapotřebí spojené síly X a pěti dalších Reploidů. Jeho útoky jsou zničující, je schopen střídat odpor mezi útoky Combat a Shot a regenerační schopnosti, dokud jeho výstup Supra-Force Metal nebyl oslaben poškozením.
Druhá fáze Epsilonu mu umožňuje sundat si pouta a jeho výstup Supra Force Metal je mírně zvýšen.