Kenyapotamus je možným předkem žijících hrochů, kteří žili v Africe zhruba před 16 až 8 miliony let během miocénu. Jeho název odráží, že jeho fosilie byly poprvé nalezeny v novodobé Keni.
Ačkoli je o Kenyapotamovi známo jen málo, jeho zubní vzor se podobal chrupu rodu Xenohyus, evropského tayassuida z raného miocénu. To vedlo některé vědce k závěru, že hroši jsou nejvíce příbuzní moderním pekari a suidaepigům.
Nedávný molekulární výzkum naznačil, že hroši jsou příbuznější kytovcům než jiným artiodaktylům. Morfologická analýza fosilních artiodaktylů a velryb, která zahrnovala také Kenyapotamus, silně podpořila vztah mezi hrochy a anatomicky podobnou čeledí Anthracotheriidae.
Dvě archaické velryby (Pakicetus a Artiocetus) tvořily sesterskou skupinu kladu hroch-antropotheriid, ale tento vztah byl slabě podporován.