Spock a kapitán Kirk najdou opuštěné staré pozemské plavidlo. Posádka zachytí tlukot srdce z lodi. Je to S.S Botany Bay z 20. století. Kapitán Kirk, McGivers, Scotty a doktor McCoy se transportují na pozemské plavidlo. McGiversová informuje svou posádku, že je to spící loď s bytostmi v pozastaveném stavu. Muži zjistí, že jednomu člověku stoupá tep. McGiversová poznamenala, že je to vůdce.
Během večeře se kapitánu Kirkovi a Spockovi podaří přimět Khana, aby odhalil kousek sebe sama, když Khan dostal záchvat. Mcgivers potvrdí Khanovu pravou identitu, Leifa Ericsona. Khan přesvědčí McGiverse, aby mu pomohl zajmout Enterprise. Při setkání s Khanem se kapitán Kirk zeptá Khana na jeho cíle. Khan prohlásí, že se snažil vybudovat nový svět a poznamená, že lidé se vyvinuli tak málo. Poznamená, že Kirk je pro něj méněcenný. Khanovi se podaří uniknout a s pomocí McGiverse se Khan transportuje na loď, aby probudil své druhy. Později se Khanovi podaří vypnout všechny komunikační kanály a systém podpory života. Vyhrožuje kapitánu Kirkovi, aby se vzdal lodi nebo riskoval ztrátu své posádky. Poté, co se posádka kapitána Kirka udusila, Khan a jeho muži vyhrožují posádce, aby pomohli s obsluhou Enterprise, aby mohl dobýt planetu. Khan vyhrožuje kapitánovi, že ho zabije zvýšením tlaku. McGiver zachrání kapitána Kirka z tlakové komory. Spock a kapitán Kirk zaplaví loď anestetickým plynem. I když se Khanovi podaří uniknout do strojovny, aby způsobil přetížení, což způsobí, že loď vzplane jako slunce. Kapitán Kirk následuje Khana a porazí s ním jen s obtížemi.
Poté kapitán Kirk odsoudil Khana a jeho muže na planetu, jejíž prostředí je podobné australské trestanecké kolonii. McGivers se dobrovolně přihlásil, že bude žít s Khanem.
Postava pro Khana byla změněna z blonďatého Severčana na tmavého Khana Nooniena podle Roddenberryho přítele Wanga Nooniena. Předpokládá se, že Gene Roddenberry doufal, že se s ním Wang spojí.