Poté, co Lilo a Stitch úspěšně ukořistili všech 625 Jumbových genetických experimentů a změnili je ze špatných na dobré, dělá Velká radní Stitche kapitánem Galaktické Armady a velitelem jeho nové objednané lodi Big Red Battleship 9000. Stitch pilotuje B.R.B. 9000, když dostane za úkol znovu chytit Dr. Hämsterviela, který s Gantovou pomocí utekl z vězení. Stitch je však později zajat v zadržovací kouli Leroyem, což je nový experiment, který byl Jumba nucen vytvořit poté, co ho Hämsterviel navštívil. Leroy pak převezme funkci kapitána Galaktické Armady, stejně jako B.R.B. 9000.
Nakonec jsou však Leroy, jeho armáda klonů a Hämsterviel všichni poraženi a zatčeni. Stitch poté rezignuje na svou funkci kapitána a řekne Velké radní, že by raději zůstal na Zemi s Lilo jako součást její ʻohany.
Druhá série: „Spike“ • „Frenchfry“ • „Swapper“ • „Shoe“ • „Slick“ • „Skip“ • „Checkers“ • „PJ“ • „Ploot“ • „Snooty“ • „Retro“ • „Belle“ • „Morpholomew“ • „Spats“ • „Heckler“ • „Wishy-Washy“ • „Phoon“ • „Bugby“ • „Rufus“ • „Shush“ • „Lax“ • „Remmy“ • „Mrs. Hasagawa’s Cats/Ace“ • „Glitch/Woops“ • „Snafu“ • „Link“