Menstruační kalíšek je uzpůsoben k tomu, aby byl používán opakovaně po dobu několika let, jeho dopad na životní prostředí je tudíž mnohem nižší než v případě jednorázových vložek a tamponů. Ty po použití vyhodíte do komunálního odpadu a v lepším případě poputují do spalovny, v horším si několik desítek let poleží na skládce. Kalíšek sice rovněž není recyklovatelný, v porovnání s jednorázovými hygienickými potřebami je to ale jen zanedbatelný kus odpadu. Navíc do půdy menstruační kalíšek nevylučuje žádné nebezpečné látky.
