Posádku Enterprise sužuje podivná vesmírná pohroma, která drasticky snižuje jejich zábrany na nebezpečnou míru a způsobuje naprostý chaos.
Enterprise dorazí na Psí 2000, zmrzlou planetu bez života. Spocks proskenuje zmrzlou osobu a řekne poručíku Joeovi Tormolenovi, aby to tu zkontroloval. Spocks najde na podlaze zmrzlou ženu a prohledá okolí. Joe se vrátí a ohlásí, že všichni včetně šesti vědců jsou mrtví bez známek boje. Rozhlédne se kolem a po sundání rukavic se poškrábe na nose. Na Joeovu ruku sáhne červená látka. Spock ohlásí kapitánovi, že všechny něco zabije. Na Enterprise muž zaznamená, co pozoroval: personál je zmražen, zatímco systém podpory života je vypnutý. Spock a Joe se vrátí na Enterprise a oba jsou v dekontaminační komoře. Doktor McCoy stanoví diagnózu Spocka a Joea a oznámí, že jsou v pořádku. Vyjádří se o Spockově zelené krvi, zatímco Spock je rád, že jeho anatomie je jiná než jejich. Joe je viděn, jak se škrábe na ruce. Když kapitán Kirk dorazí, Joe oznámí, že to bylo hrozné. Spock prohlašuje, že se budou muset podívat na pásky, jestli nenajdou další stopy. Na poradě Spock říká, že by to mohla být forma vesmírného šílenství a že spektrální analýza nemá kontaminaci. Kapitán Kirk říká, že prostředí tady dole by mohlo něco způsobit. V jídelně Joe najde něco na dlani svých rukou. Sulu se setká s Joem, který řekne Suluovi, aby odešel. Joe se ptá, co tady venku dělají a k čemu je to dobré. Vytáhne nůž a ukáže na Sulua. Joe se podělí o to, co viděl na planetě a obrátí nůž proti němu. Jakmile se Riley pokusí zabránit Joeovi, aby se bodl, Sulu se přidá, aby pomohl Rileymu. I když se Joe zraní. Když Riley volá o pomoc přes interkom, najde něco na svých dlaních a snaží se to setřít.
Kapitán Kirk mluví do svého kapitánského deníku o nové nemoci. Enterprise se blíží k Psí 2000. Spock poznamenává, že tato planeta by byla jako Země, kdyby neměla slunce. Riley a Sulu si začnou mnout prsty. Na operačním sále doktor McCoy pracuje na Joeově těle a zašívá ránu. Sestra Chapelová informuje, že Joeova dechová frekvence klesá. Doktor McCoy se diví, proč Joe umírá, a podá mu lék na stabilizaci Joea. Joe však o několik vteřin později umírá. Spock hlásí kapitánu Kirkovi, že planeta kondenzuje ve své velikosti. Kapitán Kirk míří k ošetřovně. Mezitím Sulu řekne Rileymu, že se hodně potí, a míří někam pryč. Na ošetřovně doktor McCoy prohlašuje, že udělal vše, co bylo možné. Když Spock zjistí, že Sulu není na jeho místě, pošle někoho na Suluovo místo. Pak Riley začne blábolit o irské šlechtě. Spock nechá Nyotu, aby zaujala Rileyho místo navigátora a řekne Rileymu, aby zamířil na ošetřovnu. Riley jde bizarním způsobem k ošetřovně a mluví se sestrou Chapelovou o Joeově smrti. Komentuje sestřiny hezké oči a jak Joeova chyba byla, že se nenarodil jako Ir. Sestra si všimne, že ji svědí dlaně. Mezitím Sulu začne šermovat rapírem. Čeká na dva muže a říká jim, aby s ním bojovali. Sulu oba muže vyděsí.
Scotty informuje kapitána Kirka, že motor byl vypnut a že potřebují 30 minut na zprovoznění motoru. Kapitán Kirk žádá můstek, aby našel Spocka. Na ošetřovně doktor McCoy postupně našel sérum, které vyléčí Sulu. Řekne můstku, že nemoc je ve vodě a přenáší se mezi lidmi potem. Řekne laboratoři, aby připravila séra. Kapitán Kirk najde Spocka přemoženého lítostí nad jeho matkou. Několikrát udeří Spocka, aby ho z toho dostal. Spock vrazí kapitánu Kirkovi facku. Kapitán Kirk naléhá na Spocka, aby se dostal do strojovny a uvědomí si, že má nemoc. Spock se vzpamatuje a odchází se Scottym. Kapitán Kirk míří k můstku. Doktor McCoy podává sérum kapitánu Kirkovi. Kapitán Kirk říká strojovně, aby provedla hyperbolický kurz. Výsledkem je, že loď odvrátila náraz do planety, ale motory implodovaly. Sulu hlásí, že Star Date míří zpět, zatímco kapitán Kirk si uvědomuje, že míří zpět v čase. Kapitán Kirk jim říká, aby obrátili kormidlo, které je vrací zpět do jejich času. Spock hlásí, že se vrátili o 3 dny zpět a poznamenává, že tento vzorec by jim mohl pomoci cestovat v čase.
“Nahý čas” byl původně zamýšlen jako dvoudílná epizoda s Enterprise cestující zpět v čase jako součást cliffhangeru.Velká část zápletky pro druhou polovinu nedokončené epizody bude použita v budoucí samostatné epizodě, “Tomorrow is Yesterday”.
George Takei poznamenal, že tato epizoda byla jeho nejoblíbenější ze všech Star Treku.V rámci přípravy na svou roli v této epizodě se musel naučit šermovat a velkou část svého volného času strávil cvičením s křídlákem.
Tato epioda také vyústila v pokračování pocty „The Naked Now“ v budoucím seriálu Star Trek: The Next Generation, kde byli budoucí členové posádky Enterprise nakaženi podobnou nemocí.