Vydra japonská je vyhynulý poddruh vydry dříve rozšířený v Japonsku. Pochází z 80. let 19. století, byla dokonce k vidění v Tokiu. Ve 30. letech se populace náhle zmenšila a savec téměř zmizel.
Populace tohoto druhu ve 30. letech minulého století vřeštěla a savec téměř zmizel. Od té doby byl spatřen pouze několikrát, v roce 1964 ve Vnitrozemském moři Seto a v moři Uwa v letech 1972 a 1973. Poslední oficiální pozorování proběhlo v jižní části prefektury Kóči v roce 1979, kdy byl vyfotografován v ústí řeky Šinjo v Susaki. Následně byl zařazen mezi „kriticky ohrožené“ druhy na japonském Červeném seznamu. Dne 28. srpna 2012 byla vydra japonská oficiálně prohlášena za vyhynulou ministerstvem životního prostředí.