Holotyp je jeden z několika možných biologických typů. Typ je to, co fixuje jméno na taxon. Holotyp je jediný fyzikální příklad (nebo ilustrace) organismu, o kterém je známo, že byl použit, když byl druh (nebo níže postavený taxon) formálně popsán. Je to buď jediný takový fyzikální příklad (nebo ilustrace) nebo jeden z několika takových, ale výslovně označen jako holotyp.
Například holotyp motýla Lycaeides idas longinus je v držení Muzea srovnávací zoologie na Harvardově univerzitě a holotyp vyhynulého savce Cimolodona na Albertově univerzitě.
Holotyp nemusí být nutně „typický“ pro tento taxon, i když by v ideálním případě měl být. Někdy je holotypem jen fragment organismu, například v případě vzácné fosilie. Holotyp Pelorosaurus humerocristatus, velkého býložravého dinosaura z období rané jury, je fosilní kost z nohou uložená v Přírodovědném muzeu v Londýně. Za neobvyklých okolností může být jako holotyp předložena i kvalitní fotografie. I když je následně nalezen lepší exemplář, holotyp není nahrazen.
Při absenci holotypu (např. byl ztracen) může být vybrán jiný typ, z řady různých druhů typů, v závislosti na případu. Všimněte si, že v ICBN a ICZN jsou definice typů podobné v úmyslu, ale nejsou totožné v terminologii nebo základním pojetí.
Například jak v ICBN, tak v ICZN je „neotyp“ typ, který byl později jmenován v nepřítomnosti původního holotypu. Kromě toho je podle ICZN Komise zmocněna nahradit holotyp „neotypem“, když se ukáže, že holotyp postrádá důležité diagnostické vlastnosti potřebné k odlišení druhu od jeho blízkých příbuzných. Například archosauří plaz Parasuchus hislopi Lydekker podobný krokodýlům z roku 1885 byl popsán na základě premaxilárního rostra (část rypáku), ale to již nestačí k odlišení Parasuchu od jeho blízkých příbuzných. To učinilo z názvu Parasuchus hislopi nomen dubium. Texaský paleontolog Sankar Chatterjee navrhl, aby byl označen nový typový exemplář, kompletní kostra. Mezinárodní komise pro zoologickou nomenklaturu případ posoudila a souhlasila s nahrazením původního typového exempláře navrhovaným neotypem.
Postupy pro označení exempláře nového typu při ztrátě originálu vstupují do hry u některých nedávných, vysoce sledovaných popisů druhů, ve kterých exemplář označený jako holotyp byl živým jedincem, kterému bylo dovoleno zůstat ve volné přírodě (např.). V takovém případě není k dispozici žádný skutečný exemplář typu ke studiu a existuje možnost, že – pokud by se vyskytla jakákoli vnímaná nejednoznačnost v identitě druhu – následní autoři se mohou odvolávat na různé klauzule v kodexu ICZN, které umožňují označení neotypu. Pozoruhodné je, že kodex výslovně uvádí, že označení neotypu musí být založeno na skutečném fyzickém exempláři, který je „majetkem uznávané vědecké nebo vzdělávací instituce“, ale u holotypu takový požadavek neexistuje.
V rámci ICBN by také mohl být takovým postupem určen náhradní typ, který by se však nazýval „konzervovaný typ“. Konzervovaný typ by však nebyl určen v případě nedostatečně jasného typu: v takovém případě by mohl být určen doplňkový a upřesňující typ, takzvaný „epityp“. Při mluvení o typech je třeba velké opatrnosti, protože definice jsou velmi přesné.