Ve filmu žije Jim v hostinci Benbow v městečku Bristol v Anglii. Jeho matka je „ve městě“ a on se musí starat o hostinec sám. Jediným hostem v hostinci je Billy Bones, námořník, který často tráví svůj čas pitím rumu. Hostinec navštěvuje Black Dog, bývalý Kostův člen posádky, který dává posledně jmenovanému muži Černou skvrnu. Jim dostane mapu k Flintovu pokladu krátce předtím, než Kost zemře na infarkt.
Jim je malým synem majitelů hostince Admirál Benbow. Starý opilý námořník jménem Billy Bones se stává dlouhodobým nájemníkem v hostinci. Jim si rychle uvědomí, že se Bones skrývá a že se obzvlášť děsí setkání s neznámým námořníkem s jednou nohou. Bonese navštíví jeho posádka během následujících měsíců dvakrát, druhou návštěvou je Pew, který Kostrovi předá Černou skvrnu, pirátské předvolání, s upozorněním, že má čas do deseti hodin, a on na místě padne mrtev. Jim a jeho matka otevřou Kostrovu námořní truhlu, aby si vyzvedli dlužnou částku za Bonesův pokoj a stravu, ale než stihnou spočítat dlužné peníze, uslyší piráty blížící se k hostinci a jsou nuceni uprchnout a skrýt se, Jim si s sebou z truhly vezme záhadný balíček z nepromokavého plátna. Jim přichází do domu místního statkáře Squira Trelawneyho a matčina přítele a patrona doktora Liveseyho. Společně prozkoumají balíček z nepromokavého plátna, který obsahuje lodní deník s podrobnostmi o pokladu uloupeném během kariéry kapitána Flinta a podrobnou mapu ostrova s vyznačenou polohou Flintových pokladů. Squire Trelawney okamžitě plánuje vybavit plachetnici, aby poklad s pomocí doktora Liveseyho a Jima našla.
Když Jim jede do Bristolu a navštíví Dlouhého Johna Silvera v hospodě Spy Glass, okamžitě se v něm vzbudí podezření: Silverovi chybí noha, stejně jako muži, před kterým varovala Kostička, a v hospodě sedí Černý pes. Černý pes při pohledu na Jima uteče a Silver popírá veškeré vědomosti o uprchlíkovi tak přesvědčivě, že si získává Jimovu důvěru. Navzdory pochybnostem kapitána Smolletta o misi a Silverově osobně vybrané posádce, Hispaniola vyplouvá do Karibského moře. Když se blíží k cíli, Jim zaleze do lodního sudu s jablky, aby si vzal jablka. Když je uvnitř, zaslechne Silvera, jak tajně mluví s některými dalšími členy posádky. Silver přiznává, že byl kormidelníkem kapitána Flinta a že několik členů další posádky byli také kdysi Flintovi muži a on rekrutuje další muže z posádky na svou stranu. Poté, co bude Flintův poklad nalezen, Silver zamýšlí zavraždit důstojníky Hispanioly a kořist si nechat pro sebe a své muže. Když se piráti vrátí do svých kotvišť, Jim varuje Smolletta, Trelawneyho a Liveseyho před hrozící vzpourou.
Když dorazí na Ostrov pokladů, většina Silverových mužů okamžitě vystoupí na břeh. I když si to Jim ještě neuvědomuje, Silverovi muži mu darovali Černou skvrnu a požadovali, aby se pokladu okamžitě zmocnili, čímž zahodili Silverův vlastní pečlivější plán, jak odložit otevřenou vzpouru nebo násilí, dokud nebude poklad bezpečně na palubě. Jim přistane se Silverovými muži, ale uteče od nich téměř ihned, jakmile je na břehu. Jim se ukrývá v lese a vidí Silvera, jak vraždí Toma, člena posádky věrného Smollettovi. Utíká o život a setká se s Benem Gunnem, dalším bývalým členem Flintovy posádky, který byl vysazen na ostrově tři roky, ale který se k Jimovi chová laskavě výměnou za šanci dostat se zpět do civilizace. Později se Jim připojí k Trelawneymu, Liveseymu a jejich mužům u opuštěné opevněné ohrady na ostrově, dokud Silver a jeho piráti nenapadnou ohradu, ale ti jsou odraženi v zuřivé bitvě.
Během noci se Jim proplíží z ohrady, vezme Ben Gunnův korakl a pod rouškou tmy se přiblíží k Hispaniole. Přeřízne kotevní lano lodi, nechá ji unášet a mimo dosah pirátů na pobřeží. Po rozednění se mu podaří znovu se přiblížit ke škuneru a nalodit se na něj. Ze dvou pirátů, kteří zůstali na palubě, je naživu jen jeden: kormidelník Israel Hands. Souhlasí, že Jimovi pomůže kormidlovat loď na bezpečnou pláž výměnou za lékařské ošetření a brandy, ale jakmile se loď přiblíží k pláži, Hands se pokusí Jima zavraždit. Jim mu unikne tím, že vyleze na lanoví, a když se ho Hands pokusí bodnout dýkou, Jim Handse zastřelí. Poté, co Hispaniolu bezpečně vytáhl na břeh, Jim se pod rouškou noci vrátí k ohradě a proplíží se zpět dovnitř. Kvůli tmě si až příliš pozdě uvědomí, že ohrada je nyní obsazena piráty a on je snadno zajat. Silver, jehož vždy nejisté velení se stalo tenčím než kdy jindy, se chopí Jima jako rukojmí a odmítá požadavky svých mužů, aby ho zabili nebo mučili kvůli informacím.
Následující den se rozzuření piráti vrhnou na Silvera a Jima, ale Ben Gunn, doktor Livesey a jeho muži piráty překvapí, dva zabijí a zbytek rozeženou. Silver se vzdá doktoru Liveseymu a slibuje, že se vrátí ke své službě. Odcházejí do Ben Gunnova jeskynního domu, kde má Gunn poklad ukrytý už několik měsíců. Poklad je rozdělen mezi Trelawneyho a jeho věrné muže, včetně Jima a Bena Gunna, a ti se vracejí do Anglie a nechávají přeživší piráty vysazené na ostrově. Silver unikne s pomocí ustrašeného Bena Gunna a malé části pokladu. Jim vzpomíná na Silvera a přemítá, že „troufám si tvrdit, že se setkal se svou starou Negress [svou ženou] a možná stále žije v pohodlí s ní a kapitánem Flintem [svým papouškem]. Lze v to doufat, předpokládám, protože jeho šance na útěchu v jiném světě jsou velmi malé.“
Jim se vrací do hostince Benbow se svým podílem z pokladu. Nakonec hostinec převezme, ale později ho prodá. Na stará kolena stále žije u moře a v noci stále slyší hlas Silverova papouška.