Lilo, Stitch, Jumba a Pleakley jsou galaktickou aliancí poctěni jako hrdinové. Jumba opět dostane zabavený klíč od své laboratoře, Pleakleymu je nabídnuto místo předsedy pozemských studií na G.A.C.C. (Galactic Alliance Community College) a Stitch je jmenován kapitánem galaktické armády a velitelem své nově objednané lodi BRB-9000 (Big Red Battleship 9000). Lilo je jmenována velvyslankyní galaktické federace na Zemi a jediným strážcem Stitchových „bratranců“. Než odejdou, Lilo dá Jumbovi svou oblíbenou desku Elvise, Pleakley těžítko (což je ve skutečnosti pozemský kámen) a Stitch náhrdelník s Kū tiki (havajský bůh síly).
Gantu se ve své lodi rozhodl, že když se mu nepodařilo zachytit všechny experimenty (kromě 625), dostane doktora Hämsterviela z vězení. Vezme dvoumístný raketoplán, nechá 625 o samotě a pomůže Hämstervielovi utéct z vězení. Stitch je pak pověřen, aby Hämsterviela znovu chytil. Hämsterviel a Gantu vtrhnou do Jumbovy laboratoře a donutí Jumbu vytvořit zlé dvojče Stitche, Leroye, aby porazil Galaktickou alianci. Stitch dorazí a po boji je poražen, když se v nevhodnou chvíli objeví Pleakley, který Stitche rozptýlí natolik, že ho Leroy zamkne do skleněné kapsle. Hämsterviel odhalí své plány naklonovat armádu Leroyů, aby ovládl Galaktickou alianci. Před odletem do Tura Hämsterviel zamkne Jumbu, Pleakleyho a Stitche v Pleakleyho lodi a pošle plavidlo do černé díry.
Na Zemi Leroyův klon získá Lilovu knihu výstřižků „bratranců“ a rychle je všechny pochytá (spolu s Mertlem). Lilo a Reuben dorazí do Tura, ale už je pozdě; Hämsterviel převzal vládu, dělá z Velké radní svou recepční a přikáže Gantu, aby je zavřel. Gantu uvězní Lila a Reubena, ale rozhodne se je propustit poté, co ho Hämsterviel vyhodí. Po těsném kontaktu s několika Leroyovými klony jsou uvězněni. Vše je ztraceno, dokud se náhle neobjeví dodávka G.A.C.C. Bez času na vysvětlování nastoupí Lilo, Reuben a Gantu a zamíří k Zemi. Na Zemi původní Leroy nahnal všechny experimenty na velký stadion, kde se bude odehrávat „Alohapalooza“. Objeví se BRB-9000 a Hämsterviel se připravuje zničit všechny experimenty, dokud se včas neobjeví Lilo, Stitch a ostatní a nezničí hlavní dělo BRB. Hämsterviel prozradí, že si s sebou vzal svou Leroyovu armádu jako zálohu. Stitch svolá své „bratrance“ a bitva začíná. I přes některá počáteční vítězství experimentů se brzy ukáže, že protivníci jsou lepší než oni. Jumba si pamatuje, že do Leroye naprogramoval tajný příkaz k vypnutí: Pokud zahraje „Aloha ʻOe“ od Elvise Presleyho, ostatní se deaktivují. Stitch se objeví na jevišti ve svém Elvisově oděvu a zahraje „Aloha ʻOe“ s Lilo a Reubenem, kteří ho doprovázejí, což způsobí, že Leroyovi dostanou násilné záchvaty a vypnou se. S jeho plánem zmařeným (opět) je Hämsterviel znovu zajat.
trailer k tomuto filmu.
Druhá série: „Spike“ • „Frenchfry“ • „Swapper“ • „Shoe“ • „Slick“ • „Skip“ • „Checkers“ • „PJ“ • „Ploot“ • „Snooty“ • „Retro“ • „Belle“ • „Morpholomew“ • „Spats“ • „Heckler“ • „Wishy-Washy“ • „Phoon“ • „Bugby“ • „Rufus“ • „Shush“ • „Lax“ • „Remmy“ • „Mrs. Hasagawa’s Cats/Ace“ • „Glitch/Woops“ • „Snafu“ • „Link“