Neptune City se poprvé objevilo v epizodě „Podmořský Bucky!“ Při surfování na vlnách na palubě Bucky Jake a jeho posádka spatří Marinu ve spěchu se svými delfíními přáteli informujícími Jakea a posádku podvodní mořská panna město legendy Neptune City potemnělo a titěrní piráti nabízejí pomoc.Bucky odhaluje posádce schopnost přeměnit se v ponorku, což umožňuje mladým pirátům sledovat Marinu pod vlnami. Aniž by o tom Jake a jeho tým věděli, kapitán Hook a jeho posádka je opět špehovali. Hook a pan Smee se vzdávají svého lovu na chybějící kotvu Jolly Rogera a následují ho, aby objevili jakýkoliv podmořský poklad, po kterém mohou jít.
Když Jake a jeho posádka prozkoumávají divy hloubky Nikdy moře, zjistí, že Růžová perla byla vyražena z ruky Neptunovy sochy chybějící kotvou Jolly Rogera. Zatímco se Marina a mořská štěňata snaží vrátit perlu na místo jejího odpočinku, narazí na kapitána Hooka a pana Smeeho, kteří byli původně na lovu chybějící kotvy, ale Hook si nemohl nechat ujít šanci ukrást perlu drobným pirátům. Znovu byl zmařen mladým pirátským týmem a byl poslán zpět na Jolly Rogera spolu se Smeem a chybějící kotvou, s hladovým žralokem v patách. Marina vrátila perlu zpět na sochu, když teplá záře Růžové perly zavolala mořské panny zpět do jejich domova.
Neptune City se krátce znovu objeví v epizodě „Cubbyho problém se zvířátky“, kde Stormy pomáhá Jakeovi a jeho posádce najít jeskyni Neptunu. Stormy slyšela legendy, že tam žije úžasný mořský tvor, ale nikdo ho nikdy neviděl.
Neptune City se znovu krátce objeví ve speciální epizodě „Jake’s Never Land Rescue“, Jake sleduje kouzelnou světelnou kouli, kterou poslal The Guardian k mořské panně Lagoon, Jake se dozví od Mariny a Stormy, že kouzelný inkoust ze Zlaté olihně obnoví Cubbyho mapu, zatímco Jakea pronásleduje oliheň, Neptune City může být spatřeno. Po získání inkoustu a pokračování ve své snaze zachránit Never Land před zmizením, Neptune City zmizí. Neptune City se později znovu objeví, jakmile vyroste nový strom Forever Tree a Never Land je zachráněna.
Neptune City se krátce objeví v epizodě „Jakeova královská záchrana“, zatímco královnu Coralie drží v zajetí kapitán Hook a jeho kurdějí posádka. Když královna Coralie zpívá píseň o svém království Smee, Sharky a Bones, představují si, jak by to mohlo vypadat.