Terminologie stonku a korunky
Korunní skupina je nejmenší monofyletická skupina neboli „klad“, která obsahuje posledního společného předka všech žijících členů a všech potomků tohoto předka. Vymírající organismy mohou být stále součástí korunní skupiny: například vyhynulý dodo je stále potomkem posledního společného předka všech žijících ptáků, takže spadá do skupiny ptačí koruny.
Některé organismy se nacházejí v blízkosti určité korunní skupiny, ale mimo ni. Dobrým příkladem je Archaeopteryx, který je sice jasně ptačí, ale není potomkem posledního společného předka všech žijících ptáků. Takové organismy lze zařadit do kmenové skupiny kladu. V tomto příkladu je Archaeopteryx pták s kmenovou skupinou, ale spadá do korunní skupiny obratlovců. Všechny organismy, které jsou blíže příbuzné ptákům s korunní skupinou než s jakoukoli jinou živou skupinou, jsou referovatelné ke kmenové skupině ptáků. Vzhledem k tomu, že živí ptáci jsou ze své definice v korunní skupině, vyplývá z toho, že všichni členové kmenové skupiny kladu vyhynuli; a tedy kmenové skupiny mají pouze fosilní členy. Korunní skupina a její kmenová skupina posuzované společně jsou známé jako celková skupina. Ačkoliv je kmenová skupina parafyletická, lze ji objektivně definovat odečtením korunní skupiny od celkové skupiny.
Koncept skupiny koruna-a-kmen, poprvé zmiňovaný v roce 1979,[pozn. 1] nebyl běžně používán až do jeho znovuzavedení v roce 2000.
Paleontologický význam
Umístění zkamenělin v jejich správném pořadí do kmenové skupiny umožňuje stanovit pořadí těchto akvizic, a tím i ekologické a funkční nastavení vývoje hlavních rysů dané skupiny. Kmenové skupiny tak nabízejí cestu, jak integrovat unikátní paleontologické údaje do otázek vývoje živých organismů. Dále ukazují, že zkameněliny, které byly považovány za náležející do jejich vlastní samostatné skupiny, protože nevykazovaly všechny diagnostické rysy živého kladu, s ním přesto mohou souviset tím, že leží v jeho kmenové skupině. Takové zkameněliny měly zvláštní význam při posuzování původu tetrapodů, savců a zvířat.
Uplatnění konceptu kmenových skupin také radikálně reformovalo výklad organismů Burgesské břidlice. Jejich klasifikace v kmenových skupinách na existující fýly, spíše než na vlastní fýly, výrazně usnadnila pochopení kambrijské exploze bez odvolávání se na neobvyklé evoluční mechanismy.
Budd, G. (2001), “Climbing Life’s Tree”, Nature 412: 487, doi:10.1038/35087679
Budd, G. E. (2001), „Tardigrades as ’stem-group’ Arthropods: the Evidence from the Cambrian Fauna“, Zoologischer Anzeiger 240: 265–279, doi:10.1078/0044-5231-00034
Craske, A. J.; Jefferies, R. P. S. (1989), „Nový mitrát z norského horního ordoviku a nový přístup k dělení plesu“, paleontologie 32: 69-99