Filoni také pracoval jako storyboardový umělec pro seriály Disney Channel: Kim Possible a American Dragon: Jake Long.
Pracoval také jako dohlížející režisér a výkonný producent animovaného seriálu Star Wars Rebels. Poskytoval také hlasy pro Choppera, Stormtroopery a další vedlejší postavy v seriálu.
Filoni v současnosti produkuje The Mandalorian, režíruje epizody tohoto seriálu a také natočil cameo jako pilot X-Wing v šesté epizodě první série. Produkuje také The Book of Boba Fett.