Rozmezí fosilií: 199,6–0 Ma Jurassic až dosud
Ginkgo je rod velmi neobvyklých nekvetoucích rostlin s jedním existujícím druhem, G. biloba, který je považován za živou fosilii.
Ginkgo je živoucí fosilie, s fosiliemi rozpoznatelně příbuznými modernímu Ginkgovi z Permianu, pocházející z doby před 270 miliony let. Nejpravděpodobnější rodovou skupinou pro řád Ginkgoales je Pteridospermatophyta, také známá jako „semenné kapradiny“, konkrétně řád Peltaspermales. Nejbližšími žijícími příbuznými kladu jsou cykasy, které sdílejí s dochovaným G. biloba charakteristiku pohyblivých spermií. Fosilie připisované rodu Ginkgo se poprvé objevily v rané juře a rod se rozrůznil a rozšířil po celé Laurasii během střední jury a rané křídy. V průběhu křídy klesala jeho diverzita a v paleocénu byl Ginkgo adiantoides jediným druhem Ginkga, který zůstal na severní polokouli, zatímco výrazně odlišná (a špatně zdokumentovaná) forma přetrvávala na jižní polokouli. Na konci pliocénu zmizely Ginkgovy fosilie z fosilních záznamů všude s výjimkou malé oblasti střední Číny, kde se moderní druhy dochovaly. Je sporné, zda lze fosilní druhy Ginkga ze severní polokoule spolehlivě rozlišit. Vzhledem k pomalému tempu vývoje a morfologické podobnosti mezi příslušníky rodu mohly na severní polokouli existovat pouze jeden nebo dva druhy v celém cenozoiku: dnešní G. biloba (včetně G. adiantoides) a G. gardneri ze skotského paleocénu.
Alespoň morfologicky jsou G. gardneri a druhy z jižní polokoule jedinými známými postjurskými taxony, které mohou být jednoznačně rozpoznány. Zbytek mohly být ekotypy nebo poddruhy. Důsledkem by bylo, že G. biloba se vyskytoval v extrémně širokém rozsahu, měl pozoruhodnou genetickou flexibilitu a ačkoliv se geneticky vyvíjel, nikdy nevykazoval velkou speciaci. I když se může zdát nepravděpodobné, že druh může existovat jako souvislá entita po mnoho milionů let, mnoho z Ginkgových životních parametrů do sebe zapadá. Jsou to: extrémní dlouhověkost; pomalá reprodukce; (v kenozoické a pozdější době) široká, zdánlivě souvislá, ale neustále se smršťující distribuce spojená, pokud to lze prokázat z fosilních záznamů, s extrémním ekologickým konzervatismem (omezení na narušené prostředí u potoka).
Moderní G. biloba roste nejlépe v prostředích, která jsou dobře zavlažovaná a odvodněná, a extrémně podobná fosilie Ginkgo upřednostňovala podobná prostředí: záznam sedimentů ve většině lokalit fosilie Ginkgo naznačuje, že rostla především v narušeném prostředí podél potoků a hrází. Ginkgo proto představuje „ekologický paradox“, protože i když má některé příznivé vlastnosti pro život v narušeném prostředí (klonální reprodukce), mnoho jeho dalších životních vlastností (pomalý růst, velká velikost semen, pozdní reprodukční zralost) je opakem těch, které vykazují moderní rostliny, kterým se daří v narušeném prostředí.
Vzhledem k pomalému tempu vývoje rodu je možné, že Ginkgo představuje pre-angiospermovou strategii pro přežití v narušených prostředích u potoka. Ginkgo se vyvinul v éře před kvetoucími rostlinami, kdy narušeným prostředím u potoka dominovaly kapradiny, cykasy a cykadeoidy a tvořily nízký, otevřený, křovinatý baldachýn. Ginkgova velká semena a zvyk „šroubovat“ – dorůstat do výšky 10 m před prodloužením postranních větví – mohou být adaptací na takové prostředí. Skutečnost, že rozmanitost rodu Ginkgo klesá přes křídu (spolu s diverzitou kapradin, cykasů a cykadeoidů) ve stejnou dobu, kdy kvetoucí rostliny byly na vzestupu, podporuje názor, že kvetoucí rostliny s lepší adaptací na rušení časem Ginkgo a jeho společníky vytlačily.
Ginkgo bylo použito pro klasifikaci rostlin s listy, které mají více než čtyři žilky na segment, zatímco Baiera pro ty s méně než čtyřmi žilkami na segment. Sphenobaiera byla použita pro klasifikaci rostlin s široce klínovitým listem, který postrádá výrazný listový stonek. Trichopitys se odlišuje tím, že má mnohočetně vidlicovité listy s válcovitým (ne zploštělým) vláknitým konečným dělením; je to jedna z prvních zkamenělin připisovaných Ginkgophytě.