Tento film začíná těsně před koncem, stejně jako první film. Film začíná Mudkovou masnou chýší, která exploduje do obrovské hromady sýra, a Kronk (Patrick Warburton) vypráví příběh vysvětlující, jak nedávno přišel o všechno. Pak se film přetočí do „dřívějšího téhož dne“ s úvodním motivem, který rekapituluje, jak se Kronk vzdal toho, aby byl Yzmovým (Eartha Kitt) zlým nohsledem.
Poté císař Kuzco (David Spade) rychle vysvětluje, že Kronkův New Groove je Kronkův film, ne Kuzcův. Ukáže se, že Kronk je nyní šéfkuchařem a vrchním poslíčkem Mudkovy masné chýše. Pak přijde muž v županu a přinese Kronkovi od jeho otce Papiho „llamagram“. Papi vždy nesouhlasil s kulinářskými zájmy mladého Kronka a přál si, aby se Kronk místo toho usadil s manželkou a velkým domem na kopci. Kvůli llamagramu je Kronk odsouzen k záhubě a vysvětluje číšnici Matě, jak míval to, co po něm Papi chtěl, ve dvou flashbackech.
V první flashbackové epizodě Kronk doručuje jídlo starým lidem do domova pro seniory Flickering Embers. Na cestě ven sleduje minci na provázku do Yssina (která je nyní opět člověkem, přestože má stále ocas) nového doupěte. Yzma ukazuje Kronkovi svůj trezor s lahvemi, o kterých tvrdí, že je to lektvar mládí, a říká Kronkovi, aby ho prodal starým lidem, aby vydělal dost peněz na koupi domu na kopci, aby dostal od tatínka palec nahoru. Kuzco přeruší film, aby stručně vysvětlil, že lektvar mládí byl falešný pro případ, že by si toho nějací diváci nevšimli.
Rudy, jeden ze starých lidí, nabízí Kronkovi, že dům pro seniory prodá, aby vydělal peníze. Kronk tedy od starých lidí dům pro seniory koupí a postaví tam svůj velký nový domov. Poté, co Kronk dopíše dopis tatínkovi o svém novém domě, Rudy přijde a je nahý, protože prodal své oblečení, aby vydělal peníze. Rudy vysvětluje Kronkovi, že je teď na mizině, ale pak si Kronk náhle uvědomí, že Yzma podvedla staré lidi falešným lektvarem, a tak to řeknou ostatním, než Yzmu zvolí císařem.
Staří lidé pronásledují Yzmu až k mostu a pak Yzma vypije lektvar, aby se proměnila v králíka, ale chytí ji orel. Pak Rudy řekne, že on a ostatní staří lidé žijí v uličce, a protože Kronk Rudyho omylem podvedl, velkoryse jim svůj domov vrátí.
V druhém flashbacku je Kronk zobrazen jako velitel jednotky v táboře Chippamunka. Od veverky dostane zprávu, že nový velitel jednotky jménem Birdwell (Tracey Ullmanová) usiluje o získání trofeje. Během vodní soutěže Birdwellův oddíl vyhrává bod jen proto, že Kronk šel první, když vojáci museli soutěžit v abecedním pořadí. Po ostatních soutěžích jsou vojáci nakonec vyrovnaní. Kvůli tomu je potřeba Chipmunkova roztleskávačka, aby se rozhodlo o vítězi. Kronk řekne svým Malým Chipperům, aby udělali vše pro vítězství a to dá Tipovi nápad podvádět.
Kronk a Birdwell dělají odděleně rozinkový chléb, aby rozveselili své malé Chippers, ale pak si uvědomí, že Kronk má rozinky od Birdwella a Birdwell má Kronkova vajíčka. Dohodnou se, že budou společně dělat rozinkový chléb a nakonec se do sebe zamilují. Druhý den dva vůdci jednotek vyhlásí příměří a rozdají si rozinkový chléb a malé Chippers zjistí, že Kronk a Birdwell jsou nyní zamilovaní, ale Tipo tam není, aby to viděl, protože připravuje žert, kdy dává svědící prášek do křídy na ruce vojáka Birdwella.
I přes příměří stále dělají Chipmunk Cheer-off, protože Little Chippers už dlouho neúnavně pracovali na svých sestavách. Tipo řekne Kronkovi o žertu, který provedl, a pak to zjistí Birdwell a promluví si s Tipem. Kronk přiznává, že řekl Tipovi, aby udělal vše pro to, aby vyhrál za cenu, že si Birdwella znepřátelí.
Po obou flashbackech přijede Papi (John Mahoney) a Kronk si uvědomí, že Pacha má to, co Kronk potřebuje, aby mu dal palec nahoru: ženu a děti a dům na kopci. Když dorazí Papi Kronk řekne Papimu, že Chicha je jeho žena, že Pachovy děti jsou Kronkovy děti, že Pachův dům je Kronkův dům a že Pacha (které říká Pachita) je jeho tchyně. Tipo řekne starým lidem, aby předstírali, že jsou Kronkova žena a děti a najednou nastane zmatek.
Zatímco Kronk připravuje jídlo, trouba se neustále zahřívá a exploduje v obrovské změti sýrů, přesně tam, kde film začal. Pak Kronk přizná, že lhal Papimu, ale Chaca ho utěší tím, že mu připomene, že má spoustu přátel. Pak ostatní vysvětlí Papimu, jak Kronk míval dům na kopci a přítelkyni, ale on se jich vzdal, aby ochránil své přátele. Nakonec si Kronk uvědomí, že jeho bohatství je v jeho přátelství a tím si konečně získá palce jeho otce nahoru. Papi řekne Kronkovi, že je na něj pyšný, nakonec ho přijme. Ke Kronkovu překvapení se slečna Birdwellová vrací a to znovu roznítí jeho lásku k ní. Všichni slaví tancem a Papi objímá Kronka a Birdwellovou.
Kronk’s New Groove: Ms. Birdwell • Papi • Hildy • Tina a Marge
The Emperor’s New School: Malina • Guaca • Moxie • Mr. Flaco Moleguaco • Yatta • Kavo • Dirk Brock • Homework • Azma • Ozker • Ramon
Smazáno: Huaca • Supai • Mick, Bowie, and Lemmy • Mata • Nina • Owen • Snowball
Druhá série: „Císařův nový Tuber“ • „Prostor pro vylepšení“ • „Chladné léto“ • „Vězeň Kuzcobanu“ • „Ramon je dav“ • „Guakumentary“ • „Show Me the Monkey“ • „Demon Llama“ • „Picture This!“ • „TV or Not TV“ • „Kuz-Cop“ • „How Now Sea Cow?“ • „A Fair to Remember“ • „Working Girl“ • „Curse of the Moon Beast“ • „Aww, Nuts!“ • „The Emperor’s New School Spirit“ • „Card Wars“ • „Mudka’s Secret Recipe“ • „The Emperor’s New Home School“ • „The Emperor’s New School Musical“ • „A Giftmas Story“ • „No Man Is an Island“ • „Vincent Van Guaka“ • „Air Kuzco“ • „Kronkenitza“ • „Come Fly with Me“ • „Project Poncho“ • „Citizen Kronk“ • „The Pajama Llama Dilemma“ • „Yzma Be Gone“ • „Last Ditch Effort“ • „The Good, the Bad and the Kronk“ • „Mudka’s #13“ • „Auction Action“ • „The Astonishing Kuzco-Man“ • „Guaka Rules“ • „Malina’s Big Break“ • „Hotel Kuzco“ • „Father O’ Mine“ • „Everyone Loves Kuzco“ • „Puff Piece“ • „Take My Advice“ • „Yzbot“ • „The Puma Whisperer“ • „Kronk the Magnificent“ • „Kamp Kuzco“ • „Groove Remover“ • „Overachiever’s Club“ • „The Emperor’s New Show“ • „Too Many Malinas“ • „Faking the Grade“ • „Eco Kuzco“ • „Kuzcokazooza“ • „Kuzco’s Little Secret“ • „Cornivale“ • „Graduation Groove“