První holotyp Noripterus (IVPP V.4062, typová lokalita IVPP 64045) zachoval přední část lebky a dolní čelisti, obratle a částečné končetiny a pánev. Noripterus byl dosti podobný současnému Dsungaripteru, i když byl odhadem o třetinu kratší. Má dlouhé úzké krční obratle a stejně jako Dsungaripterus hřeben a žádné zuby v přední části dolní čelisti. Zuby, které jsou přítomny, jsou dobře vyvinuté a rozmístěné poměrně daleko od sebe. Ostrý čenich je rovný a není špičatý vzhůru jako u Dsungaripteru.
Kvůli podobnosti s Dsungaripterem byl Noripterus přiřazen do čeledi Dsungaripteridae.
Rod Phobetor, pojmenovaný po řeckém bohu nočních můr, byl v roce 1982 původně popsán Natašou Bakhurinou jako druh Dsungaripterus (D. parvus), založený na jediné kosti dolní končetiny, PIN 3953. Objev dalších ostatků později, mezi nimiž byla téměř kompletní lebka, GIN 100/31, byl důvodem, proč Bakhurina v roce 1986 pojmenoval D. parvus jako samostatný rod a druhové jméno se stalo Phobetor parvus. Rodové jméno Phobetor se však již používalo jako mladší synonymum druhu sochařiny, konkrétně arktického staghorna sochařiny, Gymnocanthus tricuspis (synonymum „Phobetor tricuspis“ Krøyer, 1844), a tudíž nedostupné. V roce 2009 Lü a jeho kolegové znovu prozkoumali velkou část známého fosilního materiálu dsungaripteridu a zjistili, že „Phobetor“ je k nerozeznání od Noripterus, což způsobilo, že jej označovali jako mladší synonymum.
Přiřazením materiálu „Phobetor“ k Noripterus se zvětšuje známá velikost druhého jmenovaného, protože udává maximální rozpětí křídel 4 metry (13,1 ft).
V roce 2019 byla publikována jiná topologie, tentokrát Kellnerovou a kolegy. V této studii byl Noripterus nalezen mimo Azhdarchoidea, v rámci větší skupiny Tapejaroidea, sesterského taxonu Dsungaripterus. Kladogram analýzy je uveden níže.