Bruce Boxleitner si zopakoval svou roli z původního filmu jako Alan Bradley. Cindy Morgan, která také hrála v původním filmu, namlouvá novou postavu Ma3a, i když jméno zmiňuje Lora Bradley (nyní Alanova manželka, zemřela podle časového rámce hry). Rebecca Romijn poskytuje hlas Mercuryho. Novým designem „světelného cyklu“ přispěl do hry Syd Mead. Hra vysvětlila arkádovou hru Tron, která se objevuje ve hře, a film jako založený na zkušenostech Kevina Flynna uvnitř ENCOMu v původním filmu.
Poté, co se rozhodne, že Jet je poškozený, Kernel na doporučení Mercuryho, dalšího programu, který má za úkol pomoci Ma3a, Jet ušetří a je poslán do herního programu lightcycles. Poté, co vyhraje několik zápasů, Jet s pomocí Mercuryho uteče ze zápasu. Poté, co najdou Ma3a, je server, poškozený tak, že se nedá zachránit, přeformátován a výsledkem je Mercuryho zánik. Jet uteče na internet s Ma3a a nezkompilovanou kopií Tron Legacy, aktualizací původního programu ‘Tron’, který napsal Alan Bradley, aby ochránil Ma3a. Poté, co Thorne najde na internetu kompilující program, zdá se, že Ma3a zabije, zatímco je zkompilován kód Tron a připojen k jejímu programu. Během toho Jet obdrží komunikaci od Guest, Uživatele, který přidělil Mercurymu pomoc Jet. Při přístupu k video uplinku si Jet příliš pozdě uvědomí, že Guest je jeho otec Alan, zamčený ve skladu důstojníky fConu Bazou, Popoffem a Crownem, a prosí ho, aby program Legacy nezkompiloval. Legacy se aktivuje a odhalí, že jeho jedinou funkcí je zabít jakéhokoliv Uživatele v digitálním světě. Jet unikne a fCon ho nechtěně zachrání tím, že zachytí Ma3a ve vyhledávacím programu.
Po získání opravných algoritmů nutných k digitalizaci člověka je Alan poslán na poškozený server Thorne. Jet za pomoci ICP a Kernelu dorazí k Thornemu v srdci serveru a zabije Kernela dříve, než stihne Thorneho zničit. Thorne, které opět získá jasnou chvilku, prosí o odpuštění a řekne Jetovi, jak se dostat na server fConu.
Alan a Jet proniknou na server fConu, který korporace plánuje použít k distribuci Datawraithů – digitalizovaných lidských hackerů – po celosvětové informační síti. Poté, co Alan a Jet server nabourají, generální ředitel fConu (možná Dillinger původního filmu, i když to není nikdy potvrzeno) přikáže Bazovi, Popoffovi a Crowneovi, aby se do systému dostali sami. Alan, který si chce ověřit čistotu opravných algoritmů, je odstraní, aby si je prohlédl, až budou tři digitalizovány, což vyústí v monstrózní směsici tří, která Jeta nahání do digitalizačního paprsku; načež Jet trojici odkloní z paprsku a unikne z počítače.
Hra, stejně jako film, je zasazena „dovnitř“ počítače a vesele využívá a zneužívá výpočetní konvence: hráči se ocitnou v planoucím červeném prostředí firewallu a minimalistického bílého PDA, bojují s viry při útěku z formátu a třímají odstřelovací pušku známou jako LOL, navíc zesilují poškození dovedností zvanou Megahurtz.
Vyrovnávací / zkušenostní bod je znázorněn jako softwarová verze a dovednosti jsou podprogramy, které Jet musí získat. V závislosti na prostředí se hráč může vyzbrojit pouze daným množstvím, které se vejde do dostupné paměti. Pokud jsou podprogramy napadeny viry, mohou se fragmentovat nebo infikovat a nemohou být použity před tím, než je Jet defragmentuje nebo dezinfikuje. Pokud Jet narazí na program, který nezná, může jej přenést do svého vlastního systému. Komunikace mezi programy probíhá přes IO porty.
Jet také umí najít a přečíst e-mailové zprávy v určitých systémech, které částečně odhalují pozadí hry, ale také poskytují vhled do vztahu mezi Alanem a jeho synem.
Kromě Macu byla hra také portována na Xbox s výraznými změnami v režimu single a zejména v režimu pro více hráčů. Verze pro Xbox nese název Tron 2.0 Killer App. Změny v režimu pro jednoho hráče zahrnují volitelné skákací sekvence a celkové ovládání přizpůsobené konzoli. Skutečné změny byly provedeny v režimech pro více hráčů. Přidáno je až šestnáct hráčských multiplayerových disků aréna, světelné cykly nebo režimy overRide pro systémové spojení nebo Xbox Live. Nový režim overRide umožňuje zmrzačení z pohledu první osoby s možností jezdit na světelných cyklech kdykoli. Existuje také verze aplikace Tron 2.0 Killer pro Game Boy Advance, která má jiný příběh a hratelnost než její protějšek na Xboxu. Verze hry byla plánována pro Gizmondo, ale byla během vývoje zrušena.
Kampaň pro jednoho hráče se odehrává zcela uvnitř počítačového světa (i když jsou ukázány některé cutscény z výzkumné laboratoře ENCOM). Cílem každé úrovně je obecně dokončit úkoly a najít klíče („bity oprávnění“), které umožní přístup do další úrovně.
Design herních úrovní je lineární; neexistují žádné volby, jak postupovat nebo co říkat během interakcí s ostatními postavami. Úrovně obsahují energetické mosty a brány, neonové zářící obrysy, zářivé barvy, plovoucí krabice a dlaždice, teleporty a hluboké propasti. Jetovi se něco stane, pokud spadne z výšky (nebo zemře, pokud je výška dostatečně velká) nebo ho rozdrtí určité pohybující se objekty v digitálním světě.
Jet začíná diskovou zbraní, kterou jsme viděli ve filmu; ale získává další zbraně podobné brokovnici, samopalu, odstřelovací pušce a granátům. Municí pro tyto nové zbraně je energie, kterou Jet může sbírat na různých místech během hry (výjimkou je disk, který ve své základní podobě nevyužívá žádnou energii). Ve hře se tyto zbraně jmenují disk, tyč, pletivo a míč. Ostatní zbraně jsou vylepšení těchto základních zbraní (nazývaných „primitives“).
Jetovy schopnosti jsou přizpůsobitelné, protože jeho počítačový program získává vylepšení „počítadla sestavení“ – při zisku úrovně se Jet 1.0 stává Jetem 1.1 a tak dále. Získává nové schopnosti a také výše zmíněné zbraně v podobě „podprogramů“ uložených v „archivních koších“ roztroušených po úrovních a má omezený počet paměťových slotů, do kterých si může tyto podprogramy „nainstalovat“ na svou osobu. Podprogramy začínají jako alfa-grade software, ale mohou být upgradovány na beta a zlaté statusy, které zabírají méně místa v paměti a stávají se efektivnějšími.
Jak se pohybuje úrovněmi, Jet se musí utkat s mnoha nepřáteli z nižších pater. I když žádný z nich není zvlášť silný, obvykle se objevují v ganzích, což z nich dělá větší hrozbu. Mezi běžnými úrovněmi jsou některé s bossovými nepřáteli.
S úrovněmi first-person-shooter se prolíná několik závodů světelných cyklů. Jak je vidět ve filmu, tyto závody jsou vlastně souboje v arénách, ve kterých se každý světelný cyklus pokouší zničit své protivníky tím, že je nažene do svého jetwallu. Arény obsahují „vylepšení“ (například rychlostní zóny, které ovlivňují rychlost cyklů), složitější rozvržení se stěnami a dalšími artefakty (místo „prázdné krabice“, jak je vidět ve filmu) a power-upy, které mohou být sbírány během závodů. Kromě Tronova pravidelného světelného cyklu může Jet také získat přístup k super světelnému cyklu, který využívá modernější design a nabízí větší rychlost. Tron 2.0 zpočátku vyžadoval, aby hráč vyhrál závody světelných cyklů, aby pokročil v kampani. Zpětná vazba od spotřebitelů odhalila, že mnozí měli pocit, že počítačem řízené světelné cykléry jsou neskutečně přesné v ovládání (otáčení rychlostí, kterou by člověk nedokázal, nebo například boxování), což nutí hráče čekat, až se nepřátelské světelné cykly zničí. Výsledkem bylo, že prodejce uvolnil záplatu, která toto pravidlo eliminovala.
Dodatečný režim světelného cyklu neobsahuje žádnou kampaň; místo toho je hráči nabídnut výběr z několika arén světelného cyklu.
Tron 2.0 nabízí několik multiplayerových scénářů, a to jak v režimu kampaně, tak v režimu světelného cyklu. Internet a LAN hra jsou k dispozici, i když prodejce nedoporučuje používat režim světelného cyklu přes internet kvůli jeho obecně vysoké prodlevě.
Společnost Slave Labor Graphics produkovala komiksovou minisérii Tron 2.0 nazvanou Tron: The Ghost in the Machine.
Zbraně: Identity Disc • Baton • Seznam zbraní Tron