Skupina „teplokrevných zvířat“ je polyfyletická.
Srovnání: monophyly = žlutá, polyphyly = červená, paraphyly = aqua
Polyfyletická (řecky „mnoha ras“) skupina je ta, jejíž poslední společný předek není členem skupiny.
Například skupina tvořená teplokrevnými zvířaty je polyfyletická, protože obsahuje jak savce, tak ptáky, ale poslední společný předek savců a ptáků byl chladnokrevný. Teplokrevnost se vyvíjela odděleně u předků savců a u předků ptáků, takže se nejedná o skutečné fylogenetické seskupení.
Vědecká klasifikace má za cíl seskupit druhy tak, aby každá skupina byla potomkem jediného společného předka, a odstranění skupin, u nichž se zjistí, že jsou polyfyletické, je proto společným cílem a často je podnětem k velkým revizím klasifikačních schémat. Polyfyletická skupina může být „fixována“ buď vyloučením kladů, nebo přidáním společného předka.
Názory na to, zda platné skupiny musí obsahovat všechny potomky společného předka, se různí. Skupiny, které tak činí, se nazývají monofyletické a podle kladistiky by mělo být cílem klasifikace zajistit, aby všechny skupiny měly tuto vlastnost. Mnoho dalších taxonomů by však argumentovalo, že existuje platné místo pro skupiny, které jsou parafyletické, tj. obsahují svého posledního společného předka, ale neobsahují všechny potomky tohoto předka.
Kladistika obecně odrazuje polyfyletické skupiny
Ve většině kladistických škol taxonomie se existence polyfyletických skupin (stejně jako parafyletických skupin) v klasifikaci nedoporučuje. Monofyletické skupiny (tedy klady) jsou těmito myšlenkovými školami považovány za nejdůležitější seskupení organismů, a to z těchto důvodů: